Pitagoras jest pierwszym polskim kompleksowym programem do nauki matematyki. Nacisk w programie położony jest na naukę metodyki rozwiązywania zadań obowiązujących na kolejnych etapach nauki. Program potrafi ocenić wyniki ucznia oraz diagnozować jego dokonania. Na bazie Pitagorasa w bardzo przejrzysty sposób można poznać swoje niedociągnięcia w zrozumieniu materiału.
Pitagoras posiada szereg mechanizmów uniemożliwiających "oszukanie" oceny znajomości nauczanego materiału, co pozwala traktować ten program jako najtańszego lecz wymagającego korepetytora. Fachowość i merytoryczną poprawność materiałów teoretycznych zawartych w Pitagorasie, gwarantowana jest autorytetem ich autora - doktora matematyki Uniwersytetu Jagiellońskiego.
W fazie nauki program zadaje pomocnicze pytania naprowadzające i wyjaśnie kolejne etapy rozwiązywania zadań. Z pomocy tej można stopniowo rezygnować, gdyż celem końcowym jest samodzielne rozwiązywanie zadań. Zadania często można rozwiązywać na wiele sposobów. Wskazówki proponują taki sposób, który minimalizuje szansę popełnienia błędu.